之前作为康斯托克帮凶的路特斯兄妹,在研究中获得了穿行平行时空的能力,同时也知道了康斯托克的计划可能带来的未来。在康斯托克对两人进行暗杀之后,两人也就站到了他的对立面。于是乎,在游戏的一开始,正是路特斯兄妹在1912年将失去女儿后颓废潦倒19年的布克从他的时空中带到了康斯托克所在的哥伦比亚城。有趣的是,在康斯托克所在的世界中自然是没有布克的,被强行带到这个世界的布克记忆发生了混乱,产生了重组,这就是游戏结尾处装扮成船夫的路特斯兄妹看着瘫倒在地的布克所说的话的意思。康斯托克在1893年夺走安娜时所说的那句“bring back the girl,then wipe out the debt”在布克记忆重组后被布克以为是委托人所说的话,以为是让他到哥伦比亚城带回伊丽莎白。有趣的是这句话也是一语双关,1893年从康斯托克口中说出来自然指的是“交出安娜,抵消债务”,而在1912年的布克口中,是其潜意识中“带回伊丽莎白,来赎自己当年出卖女儿的罪孽”的表达。后面的情节大家就都知道了。布克一路神挡杀神,佛挡杀佛,救出了伊丽莎白,干掉了康斯托克。但是,路特斯兄妹虽然能从平行世界中找来布克摧毁这个世界中康斯托克的计划,那无数平行世界中的无数康斯托克总有能够完成计划的一个,而布克看到的老年伊丽莎白就是可能的未来之一。有这个未来存在,那么这一切就还有发生的可能,被洗脑的伊丽莎白也可能影响到其他的时空,无论杀死多少个时空中多少个康斯托克都不可能从根源上解决问题。
因此,唯一的解决之道就是回到游戏的第一个FLAG重新选择。而这个选择不能是已经存在的两个选择中的任何一个,否则都将无限的循环下去。所以,唯一的选择就是在这里溺死布克,那么一切都将不会发生,既没有布克,也没有康斯托克,甚至没有伊丽莎白和哥伦比亚城。
其实游戏中很多暗示都已经提示了人物的命运,比如路特斯兄妹最爱说的那句“死的,已死的,终将死去;活的,活过的;将继续活着”。游戏中由于时空的穿梭很多人都在生死之间徘徊,一个重要的标志就是间断发作的鼻血。最开始游戏中是被布克杀死的敌人在时空发生转移后,虽然复活了,但都出现神智混乱和口鼻出血。而布克在来到爆发革命的哥伦比亚城之后,发现这个世界的自己已经死亡并且被当成烈士,也出现了记忆混乱和口鼻出血。之后每次回忆起自己来到这个世界之前的记忆片段时,布克都会因为记忆混乱而口鼻出血。都透露出布克在平行世界中已死的事实。其实归根到底,康斯托克和布克两人终有一人会被对方杀死,但无论谁杀死谁,都是杀死了平行世界中的自己。和那些口鼻流血,浑浑噩噩乱颤的敌人如出一辙。游戏的故事讲述的是通过穿越来改变命运,但主人公却从一开始就准定了毁灭的命运。